Voor acute ademhalingsondersteuning, bijvoorbeeld bij baby’s, kan een buisje via een snede in de huid in de luchtpijp worden aangebracht (tracheostoma). Deze manier van ademhalingsondersteuning (invasieve beademing) proberen we echter zoveel mogelijk te voorkomen. Bij de niet-klassieke vorm van de ziekte van Pompe is meestal deze invasieve vorm van beademing niet nodig.
In plaats daarvan wordt dan gekozen voor een non-invasieve vorm: hierbij vind ademhalingsondersteuning plaats met een losse verbinding naar het apparaat via een mondstuk of een neusmasker.